難病指定医療機関の電子化対応を東京都が支援!

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補助金の基本情報まとめ

| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 補助金名 | 令和7年度東京都臨床調査個人票電子化等推進事業補助金 |
| 実施機関 | 東京都保健医療局 |
| 対象地域 | 東京都内 |
| 補助率 | 2分の1 |
| 補助上限額 | 1医療機関あたり5万円(基準額10万円) |
| 申請期間 | 令和7年9月1日(月)〜令和7年10月31日(金) |
| 実績報告締切 | 令和8年3月31日(火) |
| 問い合わせ先 | 東京都保健医療局 保健政策部 疾病対策課 疾病対策担当(03-5320-4471) |
| 公式ページ | 難病指定医療機関へのお知らせ |

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申請できる医療機関の条件

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重複申請に注意!
「東京都小児慢性特定疾病医療費意見書オンライン登録システム環境整備事業費補助金」との重複申請は明確に禁止されています。自院の診療内容に合わせて、どちらか一方を選択して申請してください。
対象経費と補助額の詳細

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| 経費カテゴリ | 具体的な対象 |
|---|---|
| 情報機器購入費 | 臨床調査個人票のオンライン入力・送信に必要なパソコンの購入経費 |
| 通信環境整備費 | インターネット回線の敷設工事費、オンラインシステム接続に必要な通信機器の購入・設置費用 |
| システム関連費 | 業務システムの改修に係る経費、オンライン化対応に必要なソフトウェアの導入費用 |

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補助額の計算方法
補助金額は次の3つのうち最も少ない額になります。
- 基準額(1医療機関あたり10万円)
- 対象経費の実支出額から寄付金等の収入額を控除した額
- 基準額と実支出額(控除後)を比較して少ない方 × 補助率2分の1
最終的な補助上限は5万円です。
申請の流れ

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要件確認と書類準備 東京都保健医療局のウェブサイトにある「交付申請にあたっての留意事項」と「手続きの流れについて」を必ず読んでください。自院に難病指定医または協力難病指定医が在籍しているか、過去の交付歴がないかを確認します。
見積書の取得 パソコン購入費や回線工事費など、補助を受けたい経費の見積書を業者から取り寄せます。見積書は申請書類の一つとして提出が必要です。
申請書類の作成 以下の書類を準備します。別記第1号様式「令和7年度東京都臨床調査個人票電子化等推進事業補助金交付申請書」、別紙1「所要額調書」、別紙2「内訳書」、その他参考となる資料。記入例が公式サイトに掲載されているので活用してください。
提出(令和7年10月31日(金)まで) 東京都保健医療局 保健政策部 疾病対策課(疾病対策担当)に申請書類を提出します。提出期限は令和7年10月31日(金)です。予算が上限に達した場合は早期に受付が終了する可能性もあります。
審査・交付決定 都による審査を経て交付決定通知が届きます。交付決定後にパソコンや機器の購入・回線工事を実施します(決定前の購入は補助対象外になる可能性があります)。
実績報告書の提出(令和8年3月31日(火)まで) 事業完了後に別記第3号様式「実績報告書」を提出します。提出期限は令和8年3月31日(火)です。補助金額の確定後、指定口座に振り込まれます。

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審査のポイントと採択率を上げるコツ


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採択率を上げる4つのポイント
-
対象経費の範囲を正確に把握する — 「交付申請にあたっての留意事項」の内容を熟読し、補助対象となる経費のみを計上する
-
オンライン化への直接的な必要性を明示する — 購入するパソコンや工事が臨床調査個人票のオンライン化に直接必要であることを明確に記載する
-
見積書は具体的な内容で取得する — パソコンのスペック、回線の種類と仕様など、補助対象との整合性がわかる見積書を添付する
-
早めに申請する — 予算の範囲内での交付のため、予算上限に達した場合は早期に受付終了となる可能性がある

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問い合わせ先
東京都保健医療局 保健政策部 疾病対策課 疾病対策担当
電話番号: 03-5320-4471
問い合わせの際は、「交付申請にあたっての留意事項」と「手続きの流れについて」を事前にご確認のうえ、具体的な質問を準備してから電話することをお勧めします。
制度の背景と難病医療のデジタル化

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活用モデルケース

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| パターン | 医療機関の状況 | 活用方法 | 期待効果 |
|---|---|---|---|
| パターンA(中規模病院) | 難病指定医3名在籍、病床数120床、紙で個人票作成・郵送中 | 補助金でオンライン入力用パソコンを購入、専用回線を整備 | 事務処理時間を月あたり約10時間削減、記入ミスによる差し戻しがほぼゼロに |
| パターンB(個人診療所) | 協力難病指定医1名在籍、スタッフ5名、古いインターネット環境 | 補助金で回線工事費を賄い、安定した通信環境を整備。既存PCでOSアップデートも実施 | 5万円の補助で自己負担を最小限に抑えながら、将来のオンライン診療にも対応できる基盤を整備 |
| パターンC(大学病院・研究機関) | 難病指定医5名在籍、大量の個人票を扱う難病診療科 | 補助金で専用端末を導入し、各指定医がオンラインで個人票を入力できる体制を整備 | 大量の個人票オンライン提出が可能になり、年間事務処理効率が約30%向上 |

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東京都の医療機関向け補助金との比較

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| 補助金名 | 対象 | 補助上限額 | 補助率 | 申請期間 |
|---|---|---|---|---|
| 令和7年度東京都臨床調査個人票電子化等推進事業補助金 | 難病指定医が在籍する都内医療機関 | 5万円 | 1/2 | 令和7年9月〜10月 |
| 令和7年度訪問系介護サービス事業所に対する防犯機器等導入支援補助金 | 都内の訪問系介護サービス事業所 | 10万円 | 1/2 | 令和7年度(受付終了) |
| 令和7年度NBC災害・テロ対策設備整備補助事業 | 東京都災害拠点病院の開設者 | 約3,376万円 | — | 令和7年11月〜令和8年5月 |
| 令和7年度私立学校等結核予防費都費補助金 | 都内の私立学校等 | 1,000万円 | 基準単価による | 随時(令和7年度) |

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IT化・DX補助金との比較・組み合わせ

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難病医療費助成制度と臨床調査個人票の関係

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次回公募に向けた準備

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自院の難病指定医の在籍状況を確認 難病指定医または協力難病指定医が在籍しているか、東京都への指定申請状況を確認します。
現在のIT環境を棚卸しする 既存のパソコンやインターネット環境が臨床調査個人票のオンライン入力・送信に対応しているかを確認します。
必要な設備を特定して見積書を取得する オンライン化に必要な機器や工事の概算費用を事前に把握しておきます。
公募開始を確認する 東京都保健医療局の公式サイト(難病指定医療機関へのお知らせページ)を定期的に確認します。令和8年度の公募が開始されたら、速やかに申請書類を準備します。

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よくある質問

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