東京都の運輸業・物流業が使える補助金・助成金の全体像
佐藤
補助金エージェント編集長
室谷さん、うちの会社は都内で小さなトラック運送をやってるんですけど、最近「物流2024年問題」って話をよく聞くんです。なんかしら補助金を使って対策できないかなって。
室谷
代表取締役
ありますよ、かなり手厚く！正直、運輸業ってこの1〜2年で補助金の充実度がすごく上がってるんですよね。電動化、物流効率化、省人化と、カテゴリも豊富で。
佐藤
補助金エージェント編集長
えっ、そんなに増えてるんですか。
室谷
代表取締役
背景は2つあって。1つは「物流2024年問題」で時間外労働の上限規制が運送業にも完全適用されたこと。もう1つは国の脱炭素政策でトラックのEV化が急加速してること。この2つを国が本気で支援してるので、今が一番補助金を取りやすい時期と言えますね。
佐藤
補助金エージェント編集長
なるほど、タイミングがいいわけですね。東京都ならではの補助金もあるんですか？
室谷
代表取締役
あります！東京港のモーダルシフト補助金とか、低公害車の買換え支援とか、東京都独自の制度もしっかりあります。全国制度と組み合わせると、かなりの支援を受けられますよ。
【電動化・脱炭素】商用車EV化を国が超強力に支援
佐藤
補助金エージェント編集長
電動化補助金ってどんな規模感なんですか？
室谷
代表取締役
令和7年度補正予算で「商用車等の電動化促進事業（トラック）」が175億円規模の予算で動いてます。これ、電気トラック・PHEVトラック・燃料電池トラックを導入するときに、ガソリン車との差額分の大部分を補助してくれる制度です。
佐藤
補助金エージェント編集長
175億円！でも差額ってけっこう大きくないですか？
室谷
代表取締役
そうなんですよ、電気トラックってまだ従来車より数百万円高い。だからこそ、その差額の2分の1とか3分の1を補助してもらえると、導入ハードルがかなり下がるんです。一般財団法人環境優良車普及機構（LEVO）が執行機関になってます。
佐藤
補助金エージェント編集長
タクシーやバスはどうなんですか？
室谷
代表取締役
別枠で「令和6年度補正予算 商用車等の電動化促進事業（タクシー・バス版）」があって、こちらも約295億円規模です。タクシー事業者さんやバス会社さんはこっちですね。
佐藤
補助金エージェント編集長
組み合わせたら相当な支援額になりますね。
室谷
代表取締役
充電設備の設置費用も一緒に補助対象になるのがポイントです。車両だけじゃなくて、充電インフラ整備まで含めて支援してもらえる（笑）。
| 補助対象 | 補助金名 | 補助規模 | 主な補助対象 |
|---|---|---|---|
| 電気トラック | 商用車等電動化促進（トラック） | 175億円規模 | BEV/PHEV/FCV/水素内燃トラック+充電設備 |
| 電気タクシー・バス | 商用車等電動化促進（タクシー・バス） | 295億円規模 | EV/PHEVタクシー・バス+充電設備 |
| 建設機械のEV化 | 商用車等電動化（建設機械） | 約14.3億円上限 | GX建設機械認定を受けた電動建機 |
佐藤
補助金エージェント編集長
建設機械も入ってるんですね、意外でした。
室谷
代表取締役
運輸業に隣接する建設現場でも使う機械なので。GX（グリーントランスフォーメーション）建設機械の認定を受けたものが対象で、電動建機と従来機の差額の3分の2か、本体価格の2分の1のどちらか低い方が補助されます。
電動化補助金 申請の注意点
- 購入前の申請が原則（購入後申請は一部可能）
- GビズIDの事前取得が必要（審査に2〜3週間かかる）
- 充電設備と車両を同時申請すると効率的
- 補助金は後払い（購入資金は先に用意する必要あり）
【東京都独自】東京港・モーダルシフトで物流効率化
佐藤
補助金エージェント編集長
東京都独自って、具体的にはどんな補助金があるんですか？
室谷
代表取締役
特徴的なのが「令和8年度東京港物流効率化等事業補助金」です。東京港でのトラック輸送を船舶や鉄道に切り替えるモーダルシフトを支援する制度で、補助上限は2.7億円。
佐藤
補助金エージェント編集長
モーダルシフトってどういうことですか？
室谷
代表取締役
例えば、今まで関西から東京まで全部トラックで運んでたのを、途中は船や鉄道に切り替えるって発想です。ドライバー不足の根本解決になるし、CO2削減にもなる。東京港だと5つの輸送区分があって、コンテナ1本あたり2,000円〜10,000円の定額補助が出ます。
佐藤
補助金エージェント編集長
なるほど、物流の仕組みを変えると補助が出るんですね。
室谷
代表取締役
そうです。「フィーダー輸送」（実入りコンテナで1FEU当たり3,000円）、「はしけ横持輸送」（1FEU当たり2,000円）、「港内横持輸送」（船舶で1本当たり10,000円、鉄道で2,000円）という感じで区分が細かいんです。
佐藤
補助金エージェント編集長
あと、東京都の低公害車補助金も見つけたんですが。
室谷
代表取締役
「東京都民間事業者に係る低公害・低燃費車導入促進補助金」ですね。CNG（圧縮天然ガス）自動車に切り替える中小企業向けの補助金で、3.5t超8t以下で1台10万円、8t超で1台20万円です。
佐藤
補助金エージェント編集長
EV化の前段階として使えそうですね。
室谷
代表取締役
そうですね。あとは「東京都環境保全資金融資あっせん」という制度もあって、低公害車買換えの融資利息の2分の1と、信用保証料の3分の2を補助してくれる。融資コストが実質的に半分以下になるので資金繰りが楽になります。
【全国制度】運輸業が使える定番補助金を徹底解説
佐藤
補助金エージェント編集長
全国制度でも使えるものは多いんですか？
室谷
代表取締役
ものすごく多いです（笑）。運輸業が使える代表格を紹介しますね。まず「ものづくり補助金（19次締切）」は最大4,000万円で補助率2分の1〜3分の1。配車管理システムの導入や省力化設備に使えます。
佐藤
補助金エージェント編集長
配車システム、運輸業の方がよく困ってると聞きますね。
室谷
代表取締役
AIを使った配車最適化とか、デジタル帳票システムとか、ものづくり補助金の対象になります。採択率はざっくり40〜50%程度ですね。事業計画書の質で大きく差がつく制度なので、認定支援機関に相談するのが吉です。
佐藤
補助金エージェント編集長
事業再構築補助金はどうですか？
室谷
代表取締役
「事業再構築補助金（第12回）」は最大5億円という大きな枠組みで、思い切った事業転換を支援するものです。例えば運送会社が物流倉庫事業に参入するとか、新たなビジネスモデルへの転換に使えます。
佐藤
補助金エージェント編集長
5億円はすごいですね！
室谷
代表取締役
ただし、売上要件や事業転換の要件が厳しいので注意です。GX進出類型（第13回）は電動化や脱炭素事業への転換で最大1.5億円です。
佐藤
補助金エージェント編集長
物流の効率化に使える補助金も別にありますか？
室谷
代表取締役
「農林水産省の食品等物流合理化緊急対策事業（物流生産性向上推進事業）」というのがあって、食品物流の合理化を支援する制度です。食品輸送が多い運送会社さんには刺さる制度ですね。輸出物流を整備する「輸出物流構築事業」も農水省の事業で、グローバル展開を考えてる会社向けです。
佐藤
補助金エージェント編集長
倉庫業者向けはどうですか？
室谷
代表取締役
「サステナブル倉庫モデル促進事業（一次公募）」が環境省から出ていて、営業倉庫への省CO2化・省人化機器と再エネ設備を同時導入するときに、最大1億円・補助率2分の1で支援してくれます。倉庫兼輸送会社さんにドンピシャな制度ですよ。
【人材確保・雇用】東京都の運輸業向け人手不足対策
佐藤
補助金エージェント編集長
物流2024年問題の一番のポイントって人手不足ですよね。雇用系の補助金もあるんですか？
室谷
代表取締役
そうなんです！ここが意外と見落とされがちなところで。東京都は雇用・人材系の補助金が充実してて、運輸業にも適用できるものが多いんですよ。
佐藤
補助金エージェント編集長
具体的には？
室谷
代表取締役
「令和8年度スキルアップ支援事業」は、従業員への研修費用を最大250万円助成してくれます。ドライバーのスキルアップ研修、デジタル研修、危険物取扱の資格取得支援などに使えます。東京しごと財団が運営してる制度です。
佐藤
補助金エージェント編集長
若手の定着支援はどうですか？最近、若いドライバーが続かないって話もよく聞くんですよ。
室谷
代表取締役
「若者世代職場定着促進助成金」が最大126万円で、35歳未満の若手定着支援に取り組む中小企業向けです。あと「ES（社員満足度）向上による若手人材確保・定着事業助成金」は最大300万円で、住宅・食事・健康に関する福利厚生充実に使えます。
佐藤
補助金エージェント編集長
300万円で福利厚生！それは大きいですね。
室谷
代表取締役
若手ドライバーを引き留めるための住宅手当制度や食事補助制度の導入に使えるんです。物流2024年問題で残業が減った分、基本給や福利厚生で補う必要があるので、タイムリーな制度です（笑）。
佐藤
補助金エージェント編集長
障害者雇用の補助金もありますか？
室谷
代表取締役
あります。「東京都中小企業障害者雇用支援助成金」は最大198万円、「障害者雇用スタート支援奨励金」は最大120万円です。倉庫内業務や仕分け作業など、運輸業でも障害者が活躍できる職場づくりに活用できますよ。
佐藤
補助金エージェント編集長
東京都就職氷河期世代等安定就業サポート助成金なんてのもありますね。
室谷
代表取締役
最大240万円ですね。氷河期世代（35〜55歳）の安定就業を支援する制度です。経験豊富な人材を採用したい運輸会社にはピッタリです。
| 補助金名 | 最大金額 | 対象 |
|---|---|---|
| スキルアップ支援事業 | 250万円 | 従業員研修費用 |
| ES向上若手人材確保・定着 | 300万円 | 福利厚生充実 |
| 若者世代職場定着促進助成金 | 126万円 | 35歳未満定着 |
| 中小企業障害者雇用支援助成金 | 198万円 | 障害者雇用 |
| 障害者雇用スタート支援奨励金 | 120万円 | 初めての障害者雇用 |
| 東京都障害者安定雇用奨励金 | 150万円 | 障害者の正規雇用 |
| 就職氷河期世代等安定就業サポート | 240万円 | 氷河期世代採用 |
| 正規雇用転換安定化支援助成金 | 190万円 | 非正規から正規転換 |
【働き方改革】運輸業の時間外労働削減を支援
佐藤
補助金エージェント編集長
2024年問題で残業時間の制限が来てから、現場が大変そうですよね。
室谷
代表取締役
ほんとに。「働き方改革推進支援助成金」（取引環境改善コース）は、荷主集団がトラックドライバーの荷待ち時間や荷役時間短縮に取り組む場合に助成する制度です。上限が最大1,370万円で、補助率は費用の4分の3（小規模事業者が30万円超の設備投資を行う場合は5分の4）です。
佐藤
補助金エージェント編集長
荷主側も動かないとドライバーの労働時間は減らないですもんね。
室谷
代表取締役
そうです！この制度の特徴は「荷主集団（複数の荷主が集まって）」申請できること。一社でやるより複数社で取り組む方が効果的だし、補助上限も上がります。
佐藤
補助金エージェント編集長
具体的にどんな取組が対象になるんですか？
室谷
代表取締役
予約受付システムの導入で荷待ち時間を減らす、パレットを標準化して荷役を効率化する、共同配送を始める、といった取組ですね。令和8年4月13日から申請受付を開始してます。
2024年問題で変わった規制ポイント
- トラックドライバーの時間外労働は年960時間上限（2024年4月〜完全適用）
- 違反した場合は6ヶ月以下の懲役または30万円以下の罰金
- 特定貨物自動車運送事業者（保有150台以上）は2026年度から義務化
- 改正物流効率化法に基づく計画提出・実行報告が必要になる
補助金活用の実践ポイントと申請の流れ
佐藤
補助金エージェント編集長
GビズIDって、全部の補助金で必要ですか？
室谷
代表取締役
国の補助金はほぼ全てGビズIDが必要です。東京都の制度は別の申請システムを使う場合もありますが、GビズIDを先に取っておくのが絶対おすすめ。申請直前に「まだ取得してなかった！」って2〜3週間待たされるのが一番もったいないので（笑）。
佐藤
補助金エージェント編集長
補助金は後払いっていうのも気をつけなきゃですね。
室谷
代表取締役
これは本当に大事なポイント！補助金は「立て替え払い後に精算」が基本です。例えば電気トラックを2,000万円で買って、あとから1,000万円補助金が入ってくる、というイメージ。設備を買う前の資金調達をしっかり計画しないといけません。東京都環境保全資金融資あっせんみたいな融資制度と組み合わせるのが賢いやり方ですよ。
佐藤
補助金エージェント編集長
複数の補助金を組み合わせることもできますか？
室谷
代表取締役
できます！ただし同じ費用に二重で補助を受けることはできないので注意。例えば電動トラックの購入に電動化促進事業を使って、ドライバー研修費用にスキルアップ支援事業を使う、みたいな組み合わせはOKです。
申請前に確認すべき3つのこと
- 補助率・補助上限額は会社の規模（従業員数）によって変わる制度が多い
- 申請期限は要注意（公募期間が短い制度もある。今すぐ確認を）
- 対象費用の範囲（何が補助対象になるか・ならないかを事前に確認）
まとめ 東京都の運輸業補助金 活用のカギ
佐藤
補助金エージェント編集長
今日紹介してもらった補助金、改めてまとめると何件くらいあるんですか？
室谷
代表取締役
今回の記事だけでも15件以上紹介しましたね。電動化・脱炭素系が全国規模で超手厚い、東京都独自の物流・環境系がある、人材・雇用系が東京都は特に充実している、という3本柱です。
佐藤
補助金エージェント編集長
どれから手をつければいいですか？
室谷
代表取締役
まず「今すぐできること」として2つ。GビズIDの取得と、認定支援機関への無料相談。この2つをやっておけば、どの補助金が来ても対応できます。東京中小企業投資育成株式会社や東京商工会議所に相談窓口があるので、そこから入るのがスムーズです。
佐藤
補助金エージェント編集長
ありがとうございます！物流2024年問題って大変なイメージでしたけど、補助金を使えばチャンスになりますね（笑）。
室谷
代表取締役
まさにそうです。危機感を持って補助金を活用した会社が次の10年を生き残る、って感じですよ。東京都内の補助金・助成金一覧もぜひ参考にしてください。運輸業×東京都の全制度を網羅しています。